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Diagenode核酸剪切儀BioruptorPico深度試用分析探討

瀏覽次數:4987 發布日期:2017-6-12  來源:本站 本站原創,轉載請注明出處

今年5月,比利時 Diagenode 公司 Bioruptor Pico 核酸剪切儀試用活動再傳捷報,本次試用單位上海伯豪生物使用Bioruptor Pico 進行了多項實驗均獲得了品質優良的樣品,實驗效果理想。

試用日期:2017年5月

試用單位:上海伯豪生物

試用詳情:

Sample volume: 100 µl
Tubes: 0.65 ml Bioruptor® Microtubes (Cat. No. C30010013)
Tube holder:  0.65 ml tube holder & tube adaptor for Bioruptor® Pico (Cat. No. B01200010) for 12 x 0.65 ml tubes
DNA concentration:  0.1-10 ng/µl
Sonication buffer: TE (10 mM Tris, 1 mM EDTA), pH 7.5 - 8.0
Target size:150-1000bp
Sonication cycles: 按照廠家參考循環數

儀器已經預冷,陳老師準備樣品

結果分析:

DNA concentration:  1ng/µl
Target size:150bp
Sonication cycles: 30 cycles (30 sec ON/OFF)
試用結果:樣品品質良好,超聲效果理想。三個樣品由于實際濃度有差別,所以波峰有高低。總體上波峰稍稍拖后。Pico儀器是市面上唯一一款60KHz的超聲波破碎儀,片段極限在70bp。熟悉DNA打斷實驗的都知道,目的片段越小、濃度越高越難處理。之前在新培晶試用時,由于濃度太高(50 ng/µl),導致超聲時間過長,效果一般。鏈接:http://www.boyibio.cn/news/html/?89.html

DNA concentration:  紅1 ng/µl和藍20ng/ul兩個樣品
Target size:250bp
Sonication cycles: 8 cycles (30 sec ON/90 sec OFF)
試用結果:樣品品質良好,超聲效果理想。廠家推薦濃度是(1-20ng/ul),在此范圍內超聲效果基本上是不變的。

DNA concentration:  2ng/µl
Target size:300bp
Sonication cycles: 6 cycles (30 sec ON/OFF)
試用結果:樣品品質良好,超聲效果理想。

DNA concentration:  紅2ng/µl(有誤),藍10ng/µl,綠2ng/µl,青0.2ng/µl
Target size:400bp
Sonication cycles: 6 cycles (15 sec ON/90sec OFF)
試用結果:樣品品質良好,超聲效果理想。濃度方面應該有誤,不影響分析,總的來說,超聲重復性理想,青0.2ng/µl濃度太低沒有檢測到。

DNA concentration:  紅1ng/µl,藍9ng/µl
Target size:1000bp
Sonication cycles: 8 cycles (5sec ON/90sec OFF)
試用結果:樣品品質良好,超聲效果理想。波峰明顯小于1kb,超聲循環數需要減少1-2個循環。

相關公司:上海博誼生物科技有限公司
聯系電話:021-51691651
E-mail:zhaoshengjie@boyibio.cn


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