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小麥總RNA的提取方法

瀏覽次數(shù):1487 發(fā)布日期:2015-8-13  來源:上海北諾生物科技有限公司

實(shí)驗(yàn)步驟

1. 所有容器高溫滅菌兩次,DEPC高溫滅菌,所有的試劑用DEPC配制,高溫滅菌。

2. 在一滅菌2mL管中加入:5mol/L異硫氰酸胍0.7mL、苯酚0.4mL、NaAc(pH4.0) 0.1mL。

3. 稱取0.2g小麥黃化苗的葉片,迅速在液氮中研磨成粉末,轉(zhuǎn)入已準(zhǔn)備好的離心管中,劇烈震蕩。

4. 混勻,冰浴30min。

5. 4℃,12000rpm,10min。

6. 上清至另一離心管中加0.4mL氯仿,劇烈震蕩。冰浴放置5min。

7. 4℃,12000rpm,10min。

8. 棄有機(jī)相(下層) 加入0.4mL氯仿和0.4mL酚,室溫放置5min。

9. 4℃,12000rpm,10min,棄有機(jī)相,加入等體積異丙醇。-20℃放置1h。

10. 4℃,12000rpm,10min,沉淀用70%乙醇洗兩次。

11. 室溫稍干燥。

12. 沉淀加20μLDEPC水溶解(-20℃保存)

13. RNA電泳:1%瓊脂糖膠20mL,8μL樣品,1μL樣品緩沖液,1μLSYBR,100V恒壓電泳,測(cè)OD260和OD260/OD280。

注意事項(xiàng)

1. 步驟1目的是去除RNA酶(外源)的影響。高溫滅菌兩次可以破壞RNA酶的復(fù)性過程,雖然RNA酶極易復(fù)性,但兩次連續(xù)的高溫會(huì)打亂它的復(fù)性歷程,從而使RNA酶失活。 DEPC是RNA酶的非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑。DEPC可以與RNA酶的活性中心的組氨酸咪脞環(huán)上的N結(jié)合,從而使RNA酶失活。因?yàn)镈EPC能與RNA的N結(jié)合,從而修飾RNA,所以必須將DEPC最終除去。在高溫滅菌時(shí),DEPC因高溫分解而揮發(fā)。UV也能修飾RNA,實(shí)驗(yàn)時(shí)應(yīng)避免。DEPC滅菌后稱為DEPC水,它是不含DEPC的。實(shí)驗(yàn)過程中要勤換手套,必要時(shí)要在超凈工作臺(tái)中進(jìn)行。

2. 必須提前準(zhǔn)備好變性劑。異硫氰酸胍可以變性RNA酶,也可以破細(xì)胞。本試驗(yàn)不可以用酶法破細(xì)胞。因?yàn)榈鞍酌窴的適合的條件也可以使RNA酶有活性。 NaAc酸性可以使DNA在有機(jī)相(酚相)中,而在堿性條件下,DNA和RNA都在水相中,無法分離。苯酚用于抽提DNA和蛋白質(zhì)。

3. 低溫防止內(nèi)源性RNA酶降解RNA。劇烈震蕩是使所有的細(xì)胞散開,浸在變性劑中。低溫的細(xì)胞在相對(duì)高溫的液體中是會(huì)形成一團(tuán),這樣就會(huì)使內(nèi)部的RNA沒有水解RNA的機(jī)會(huì)。小麥的黃化苗因?yàn)闆]有光合作用,所以含糖少,易于抽提。

4. 步驟6目的是去除脂類。

5. 步驟8目的是去除脂類和蛋白質(zhì)。

6. 步驟9目的是去除糖,脫水,因?yàn)轶w系高鹽(2mol/L NaAc),所以可以使RNA沉淀。

7. 步驟10注意因?yàn)樘岢龅牧亢苌伲赡懿豢梢姡噪x心要有方向標(biāo)記。

8. RNA是非常不好溶解的,所以只能稍干燥。若不溶解是因?yàn)橛刑嗟奶堑臍堄唷?/P>

9. DEPC水中應(yīng)不含RNA酶。

發(fā)布者:上海北諾生物科技有限公司
聯(lián)系電話:021-57730393,15800960770
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