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數字PCR:中山大學科學家發現可作為食管鱗癌早期檢測生物標志物

瀏覽次數:2242 發布日期:2019-11-29  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
食管鱗狀細胞癌
食管鱗狀細胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC,簡稱食管鱗癌)在我國占食管癌的90%以上。食管癌是發病率較高的惡性腫瘤之一,其發病率在全球范圍內居惡性腫瘤第8位,在我國大陸居各類腫瘤第5位,其死亡率在全球范圍居惡性腫瘤第6位,在我國大陸居第4位。(源自:中國早期食管鱗狀細胞癌及癌前病變篩查與診治共識,2015年,北京)。
環狀核糖核酸
環狀核糖核酸即circRNA(Circular RNAs)是一類不具有5’末端帽子和3’末端poly(A)尾巴、并以共價鍵形成環形結構的非編碼RNA分子。目前發現的circRNAs主要來源于基因外顯子exon,但還有其他類型,比如來源于內含子intron,基因間intergenic,反義鏈antisense,重疊區sense overlapping。
作為一類新型的非編碼核糖核酸,circRNA由于反式剪切,大量存在于真核細胞的細胞質中(定位于細胞質是miRNA海綿機制研究的充分必要條件),少部分內含子來源的circRNA存在于核酸內,具有一定的組織特異性、時序和疾病特異性,非常適合做分子標志物,故此近年來在人類癌癥研究中,引起了人們的廣泛關注,但是circRNA在食管鱗狀細胞癌中的作用(ESCC)仍不清楚。
近日中山大學附屬孫逸仙醫院廣東省惡性腫瘤表觀遺傳學和基因調控重點實驗室,在由BioMed Central出版社發行的英國Molecular Cancer雜志上發表“circGSK3β promotes metastasis in esophageal squamous cell carcinoma by augmenting β-catenin signaling”。這項研究旨在識別調節ESCC進程中新的circRNA,并探索其在ESCC的調節機制和臨床意義。該雜志影響因子10.679。(詳情請見文末)

文獻內容
該研究得出結論:
circGSK3β對于ESCC轉移有重要的促進作用,有可能成為ESCC的治療新靶點。同時血漿中circGSK3β水平有可能作為ESCC一種新的診斷和預后指標檢測的生物標志物。
方法:
使用微陣列方法篩選ESCC和臨近正常組織之間表達有差異的circRNA。在體外和體內研究特定的差異表達的circRNA (circGSK3β)對腫瘤進展的影響。
使用數字PCR方法對ESCC患者、良性病變患者和健康對照組血漿樣本中circGSK3β分析,并對血漿樣本中circGSK3β與ESCC檢出率進行相關性研究。
結果:
證明circGSK3β的表達上調與晚期ESCC患者的臨床分期和不良預后呈正相關。同時進一步揭示了circGSK3β通過與GSK3β的直接相互作用和抑制GSK3β活性對ESCC細胞的遷移和侵潤有促進作用,展現一種circRNA在癌癥進展中的新作用機制。
更重要的發現是,血漿中circGSK3β的表達可作為ESCC和ESCC早期檢測生物標志物,AUC分別為0.782和0.793。
文中描述的血漿中circGSK3β水平,使用數字PCR進行檢測,方法描述如下所示:
可復制此鏈接地址進行全文下載:
https://molecular-cancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12943-019-1095-y
Naica數字PCR平臺
法國Stilla Technologies Naica數字PCR平臺是實現DNA/RNA絕對定量的技術工具,自動生成和組裝單層平鋪的微滴,進行單分子PCR擴增,通過高分辨率的三色熒光通道檢測,自動QC質控,識別三色熒光中有效的陰陽性微滴,從而達到目的DNA/RNA的絕對定量檢測。同時提供原始數據、單微滴追溯等功能,確保數據真實可靠。
◐ 只需一步加樣操作,無需標準品和標準曲線是真正的絕對定量系統。通過對模板的有限稀釋,耐受抑制劑能力強,更有利于臨床、環境等復雜樣本的檢測。
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北京深藍云生物科技有限公司承擔法國Stilla Technologies公司中國技術示范與服務中心職能,致力于為用戶提供新型生命科學研究儀器和分析產品以及優化的整體解決方案。
期刊介紹
Molecular Cancer雜志主要接收靶向治療、分子與細胞生物學、基因組學、遺傳學、病理與腫瘤免疫學等領域相關的學術論文。
在230本腫瘤學學SCI期刊中,Molecular Cancer雜志的SCI影響因子排名前11位。據WOS檢索結果:Molecular Cancer在2017-2018年共發表357篇論文,已在2019年被引用4221次(2019.11.1),2017-2018年發表的論著、綜述文章為351篇,即時影響因子為4221/351=12.026分。
 
發布者:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
聯系電話:0512--86860010
E-mail:info@aperbio.com

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