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CETSA-Wes檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)藥物與靶蛋白結(jié)合效率

瀏覽次數(shù):18054 發(fā)布日期:2018-3-29  來(lái)源:ProteinSimple

大多數(shù)藥物是通過結(jié)合一個(gè)或多個(gè)蛋白質(zhì)來(lái)影響其功能,這就產(chǎn)生了藥物開發(fā)中的兩個(gè)常規(guī)瓶頸:識(shí)別正確的靶蛋白,設(shè)計(jì)藥物能夠有效的尋找到并結(jié)合該蛋白。但是現(xiàn)在還沒有方法能夠有效且直接的測(cè)量藥物分子到達(dá)并結(jié)合靶蛋白的方法。卡羅林斯卡研究中心科學(xué)家開發(fā)出一種稱之為細(xì)胞熱轉(zhuǎn)移(CETSA,Cellular Thermal Shift Assay)的方法(Monitoring drug target engagement in cells and tissues using the cellular thermal shift assay, D Martinez Molina, R Jafari, M Ignatushchenko, T Seki, E.A Larsson, C Dan, L Sreekumar, Y Cao, P Nordlund, Science, 2013; 341:84-7.,)該方法采用的原理是靶蛋白在結(jié)合藥物分子后通常變得結(jié)構(gòu)穩(wěn)定。

世界著名的腫瘤研究中心,安大略腫瘤研究所的科學(xué)家 Matias Casás-Selves,使用Wes 定量蛋白質(zhì)表達(dá)分析系統(tǒng)建立了細(xì)胞熱轉(zhuǎn)移實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。現(xiàn)分享其一研究數(shù)據(jù):

Ø  細(xì)胞系: 粒細(xì)胞白血病細(xì)胞系MV4-11
Ø  藥物/化合物:該所專利化合物Compound1.無(wú)關(guān)化合物Compound2
Ø  研究靶蛋白:Protein X
Ø  實(shí)驗(yàn)流程:
細(xì)胞系2.5X10^6MV4-11細(xì)胞,52℃(之前研究顯示52℃可以使Protein X變性沉淀)條件下,在0.00001-10um Compound1中孵育1小時(shí),裂解細(xì)胞,提取蛋白,使用Wes定量檢測(cè)Protein X水平。
Ø  實(shí)驗(yàn)結(jié)果預(yù)期:
如果Compound 1可以結(jié)合Protein X,則Protein X穩(wěn)定,在52℃下不會(huì)變性,可以檢測(cè)到其表達(dá)量,且表達(dá)量和Compound 1量呈劑量依賴關(guān)系。
Ø  CETSA-Wes監(jiān)測(cè)結(jié)果:

Compound劑量升高,Protein X可監(jiān)測(cè)到的表達(dá)量升高,呈劑量依賴關(guān)系,并可據(jù)此計(jì)算IC50

作為對(duì)照Compound2不結(jié)合Protein X,無(wú)保護(hù)作用,故Protein X變性沉淀,表達(dá)水平與Compound2無(wú)劑量依賴關(guān)系。

CETSA-Wes是一種創(chuàng)新的技術(shù),可以定量檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)藥物和其作用靶蛋白結(jié)合能力,將有助推動(dòng)藥物研發(fā)及藥物作用機(jī)理研究。

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